2015年1月20日 星期二

[研討會報告CP12] 蝸居東部的隱藏種:以婚姻平權為名的彩虹大臍蝸牛

[研討會名稱] 2015動物行為暨生態學研討會

[發表型式] 壁報展示

[摘要]

蝸居東部的隱藏種:以婚姻平權為名的彩虹大臍蝸牛
Cryptic landsnail species in eastern Taiwan, Aegista diversifamilia

黃致維1、李彥錚2、林思民1、巫文隆2
1國立臺灣師範大學生命科學系
2中央研究院生物多樣性研究中心

臺灣大臍蝸牛Aegista subchinensis (Möllendorff, 1884)在以往被認為廣布於臺灣全島。2003年,李彥錚博士首次注意到東、西部的臺灣大臍蝸牛族群有形態分化。初步研究透過三個DNA片段(粒線體COI、16S和核ITS2基因)重建臺灣大臍蝸牛東、西部族群和近緣種(日本石垣島的A. vermis [Reeve, 1852]和宮古島的A. oculus [Pfeiffer, 1850])的親緣關係,並以殼形態分析臺灣大臍蝸牛東、西部族群,確立臺灣東部的大臍蝸牛族群應視為一物種,命名為彩虹大臍蝸牛A. diversifamilia,以向世界各國與臺灣為婚姻平權的努力致敬。根據三個DNA片段重建之親緣關係樹顯示臺灣大臍蝸牛和彩虹大臍蝸牛為姊妹種,而四物種間的bootstrap支持度均低,無法釐清種間的親緣關係。新增九個核基因片段(共十二個基因片段)重建之物種演化樹(species tree),則顯示彩虹大臍蝸牛和宮古島的A. oculus為姊妹種。

關鍵字:八重山群島、大臍蝸牛、柄眼目、扁蝸牛、軟體動物

蝸居東部的隱藏種:以婚姻平權為名的彩虹大臍蝸牛


[研討會報告CP02] 東亞地區山椒蝸牛科 (軟體動物門:腹足綱) 之親緣關係、 親緣地理和地景遺傳學研究

[研討會名稱] 2009 年台大師大生態演化聯合學術發表會

[發表型式] 壁報展示

[摘要]

東亞地區山椒蝸牛科 (軟體動物門:腹足綱) 之親緣關係、親緣地理和地景遺傳學研究

黃致維1、林思民1、巫文隆2
1臺灣師範大學生命科學系
2中央研究院生物多樣性研究中心

親緣地理學兼顧種內演化過程與地理分布模式,為一整合性之研究學門。複雜的地理環境與地質歷史,造就台灣的高度生物多樣性。山椒蝸牛科 (Assimineidae) 廣布於南極洲以外的各大陸,且為高度物種多樣性的兩棲性蝸牛,沿海、河口、淡水和陸域環境均有不同山椒蝸牛種類棲息。目前的山椒蝸牛科的分類仍以形態與解剖構造為主,許多物種的分類近年來有大幅度變動且有許多新種發表,因此山椒蝸牛科的親緣關係亟待進一步釐清。東亞地區的山椒蝸牛科由於擁有豐富的物種多樣性,而成為絕佳的研究材料,可探討其起源、親緣關係和親緣地理學。本研究將針對以下主題:(1) 東亞地區的山椒蝸牛之親緣關係與台灣的山椒蝸牛物種來源;(2) 台灣的陸域和河口的山椒蝸牛物種之比較親緣地理;(3) 台灣山椒蝸牛 (Assiminea taiwanensis) 的地景遺傳,探討不同地景特徵對其族群遺傳之影響。用於親緣關係分析的東亞地區山椒蝸牛物種將採集或交換自韓國、日本、台灣、中國和菲律賓;親緣地理分析的部份,依照台灣的主要水系和山脈進行採集;台灣山椒蝸牛的地景遺傳分析,將針對其模式產地和台北盆地,依據不同的棲地類型進行採集。利用酚-氯仿法進行DNA粗萃取。以粒線體去氧核醣核酸 (COI, CYTB, ND1, 12S and 16S rRNA) 作為分子特徵,以最大概似法 (maximum likelihood) 和貝氏法 (Bayesian method) 重建山椒蝸牛科之親緣關係;並利用分子變方分析 (AMOVA) 和單基因型網狀脈絡圖 (haplotype network) 等方法分析親緣地理。東亞地區的山椒蝸牛科之親緣關係和台灣山椒蝸牛的地景遺傳研究將於未來釐清;本研究預期台灣的山椒蝸牛科動物相和親緣地理,可能是由擴散和地理割裂事件共同影響所形成。

關鍵字:山椒蝸牛科、地景遺傳學 、腹足綱、親緣關係、親緣地理學

東亞地區山椒蝸牛科 (軟體動物門:腹足綱) 之親緣關係、親緣地理和地景遺傳學研究


[研討會報告CP01] 應用粒線體COI片段探討台灣的河殼菜蛤族群遺傳結構

[研討會名稱] 2009 年動物行為暨生態學術聯合年會

[發表型式] 口頭報告

[摘要]

應用粒線體COI片段探討台灣的河殼菜蛤族群遺傳結構 Population Genetic Structure of Limnoperna fortunei (Dunker 1856) in Taiwan Based on Sequences of Mitochondrial Cytochrome C Oxidase Subunit I

黃致維1,2、姜鈴3
1台灣師範大學生命科學系博士班研究生
2中央研究院生物多樣性研究中心 軟體動物研究室
3彰化師範大學生物學系 助理教授

原生於亞洲大陸的淡水雙殼貝河殼菜蛤 Limnoperna fortunei (Dunker, 1856) 先後入侵至香港、台灣、日本、阿根廷、烏拉圭、巴拉圭,巴西和玻利維亞。河殼菜蛤在台灣的確定族群,先後發現於台北縣新店溪直潭壩、南投縣日月潭和桃園縣石門水庫。為釐清台灣3個水系間河殼菜蛤的族群關係,本研究應用粒線體COI片段的501個核苷酸序列,分析台灣、日本和阿根廷6個水系共326隻個體,21個變異點區分出17種單基因型。台灣 (Hd = 0.233, π = 0.000275) 和阿根廷 (Hd = 0.378, π = 0.000253) 的河殼菜蛤族群之遺傳多樣性偏低,且mismatch analysis呈現單一高峰,顯示為單次引入,且有明顯奠基者效應 (founder effect);而日本的遺傳多樣性很高 (Hd = 0.895, π = 0.00097) 和2 ~ 3個高峰的mismatch distribution,推測是多次引入所造成。H1為3國共有單基因型,推測H1可能為原生地廣布的單基因型;三個國家各有其獨特的單基因型:台灣 (H2 ~ H4)、日本 (H5 ~ H15) 和阿根廷 (H16和H 17),顯示3國的河殼菜蛤均為不同來源。除了台灣和日本的河殼菜蛤族群有明顯分化的單基因型之外,大部分單基因型間僅相差一個鹼基變異,使NJ、MP、ML、Baysien analysis和MJ network的分析結果,無法釐清多數單基因型的親緣關係。河殼菜蛤在台灣發現的3水系—新店溪、大漢溪和日月潭水系的族群遺傳多樣性均低;3個水系族群之間,至少共有2種單基因型 (H1>80 %和H2),應為奠基者效應所造成。3水系間的平均遺傳距離 (0.259 % ~ 0.387 %) 和FST值 (0.032 ~ 0.0490),顯示台灣3水系族群關係相近,推測可能是單次引入至某一水系再被引入至另外2水系,而河殼菜蛤於台灣水系間的擴散,可能透過工程船或休閒船引入至另一水域。

關鍵字:河殼菜蛤 Limnoperna fortunei、族群遺傳結構 Population genetic structure、新店溪 Shindian River、石門水庫 Shihmen Reservoir、日月潭 Sun Moon Lake

2015年1月15日 星期四

[發表研究SP02] 臺灣大臍蝸牛的東部隱藏種--彩虹大臍蝸牛 Aegista diversifamilia

分布於臺灣東部的新種--彩虹大臍蝸牛 Aegista diversifamilia
圖片採用創用CC授權 4.0版,圖片作者:黃致維 Chih-Wei Huang 

[關於此研究]

西元1884年,科學文獻首度描述臺灣大臍蝸牛Aegista subchinensis。以往,對於此種蝸牛的認知是分布於臺灣全島。然而,李彥錚博士於2003年出版的蝸牛圖鑑提及,中央山脈東部的臺灣大臍蝸牛比西部族群還大。此研究中,我們分析臺灣大臍蝸牛的東、西部族群的外殼形狀、外殼可測量形質和生殖腺特徵,加上粒線體COI、16S和核ITS2基因片段分析近緣種間的親緣關係,確認臺灣大臍蝸牛的東部族群為演化顯著單元,而命名為新種:彩虹大臍蝸牛 Aegista diversifamilia。此研究已於2014年發表在線上公開取閱(open access)的期刊Zookeys


[本文開始] 原始文獻連結在此

根據多個基因重建之親緣關係和形態證據,修訂臺灣大臍蝸牛Aegista subchinensis (Möllendorff, 1884)(柄眼目:扁蝸牛科)的分類和描述臺灣東部Aegista屬的一個新種
Taxonomic revision of Aegista subchinensis (Möllendorff, 1884) (Stylommatophora, Bradybaenidae) and a description of a new species of Aegista from eastern Taiwan based on multilocus phylogeny and comparative morphology

作者:黃致維Chih-Wei Huang 1、李彥錚Yen-Chen Lee 2、林思民Si-Min Lin 1、巫文隆 Wen-Lung Wu 2
1 國立臺灣師範大學生命科學系
Department of Life Science, National Taiwan Normal University, No. 88, Sec. 4, Tingzhou Rd., Wenshan Dist., 11677, Taipei, TAIWAN, R.O.C.
2 中央研究院生物多樣性研究中心
Biodiversity Research Center, Academia Sinica, No. 128 Academia Road Sec. 2, Nankang Dist., 11529, Taipei, TAIWAN, R.O.C.

通訊作者 Corresponding author
黃致維Chih-Wei Huang (limnoperna@gmail.com)
巫文隆 Wen-Lung Wu (malacolg@gate.sinica.edu.tw)

學術編輯 Academic editor:Menno Schilthuizen

收稿日期:2014年4月23日 | 接受日期:2014年9月7日 | 發表日期:2014年10月13日
Received: 23 Apr 2014 | Approved: 07 Sep 2014 | Published: 13 Oct 2014


摘要 Abstract

臺灣大臍蝸牛Aegista subchinensis (Möllendorff, 1884)是廣布臺灣且有形態變異的特有種蝸牛。此研究以三個基因片段(粒線體COI、16S和核基因ITS2)重建臺灣大臍蝸牛與其近緣種A. vermis (Reeve, 1852) and A. oculus (Pfeiffer, 1850)之親緣關係並推估種間的遺傳分化程度。根據親緣關係和形態分析,顯示現在認知的臺灣大臍蝸牛裡有隱藏種(新種)。新種名為彩虹大臍蝸牛A. diversifamilia,其與臺灣大臍蝸牛的區別為,彩虹大臍蝸牛的殼直徑、殼口、殼頂夾角較大,臍孔較寬,殼形較為低矮。彩虹大臍蝸牛和臺灣大臍蝸牛的分布以蘭陽溪為界。

Aegista subchinensis (Möllendorff, 1884) is a widely distributed land snail species with morphological variation and endemic to Taiwan. Three genetic markers (partial sequence of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I [COI], the 16S rDNA and the nuclear internal transcribed spacer 2 [ITS2]) were analysed to infer phylogenetic relationships and genetic divergence of closely related species of the genus Aegista, A. vermis (Reeve, 1852) and A. oculus (Pfeiffer, 1850). A new species from A. subchinensis has been recognized on the basis of phylogenetic and morphological evidences. The nominal new species, A. diversifamilia sp. n. is distinguished from A. subchinensis (Möllendorff, 1884) by its larger shell size, aperture and apex angle; wider umbilicus and flatter shell shape. The northernmost distribution of A. diversifamilia sp. n. is limited by the Lanyang River, which is presumed to mark the geographic barrier between A. diversifamilia sp. n. and A. subchinensis.


關鍵字 Keywords
柄眼目 Stylommatophora、大蝸牛超科 Helicoidea、南琉球群島 Southern Ryukyu Islands、八重山群島 Yaeyama Islands、新種 new species



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中文媒體
泛科學PanSci  以婚姻平權為名的蝸牛新種:彩虹大臍蝸牛
地球圖輯隊  挺婚姻平權 台灣學者將蝸牛命名「彩虹」
國家地理雜誌  新發表物種「彩虹大臍蝸牛」,支持多元成家
果殼網  【论文故事】新种蜗牛,倡导同性婚姻权利

英文媒體
ScienceDaily  A new land snail species named for equal marriage rights (這篇是原始新聞稿)
BBC  Hermaphrodite snail named after marriage equality
The Gardian  New species of snail named in celebration of same-sex marriage
TECH TIMES  New species of snail named in honor of same-sex marriage: Say hello to Aegista diversifamilia
IFLScience  New Species Of Snail Named For Marriage Equality

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TIME  Top 10 New Species
Mongabay  the top new animal discoveries of 2014
IFLScience  Top 10 New Species of 2014
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